农业部发布的《新饲料和新饲料添加剂管理办法》(农业部令2012年第4号)，提出申请资料包括：“有效组分、化学结果的鉴定报告及理化性质，或者动物、植物、微生物的分类鉴定报告；微生物产品或发酵制品，还应当提供农业部指定的国家级菌种保藏机构出具的菌株保藏编号”。

农业部于2014年2月1日起实施《饲料添加剂品种目录（2013）》(农业部公告第2045号)，包括微生物菌种共46种，其中细菌34种；酵母4种；霉菌8种（见附表），菌种保藏中心向社会推荐和共享符合法规要求的饲料添加剂微生物菌种。

附表：可用于《饲料添加剂品种目录（2013）》菌种名单

编号      菌种      备注      推荐编号

1 谷氨酸棒杆菌 L-赖氨酸   10065

2 布氏乳杆菌 直接添加   20294   6067

3 侧孢短芽孢杆菌(原名：侧孢芽孢杆菌) 直接添加   21185

4 产丙酸丙酸杆菌 直接添加 /

5 长双歧杆菌 直接添加   6068

6 迟缓芽孢杆菌 直接添加 甘露聚糖酶   10365 /

7 德氏乳杆菌保加利亚亚种（原名：保加利亚乳杆菌） 直接添加   6098

8 德式乳杆菌乳酸亚种（原名：乳酸乳杆菌） 直接添加 /

9 地衣芽孢杆菌 直接添加 产淀粉酶 角蛋白酶   23584   10037   10181

10 动物双歧杆菌 直接添加   21717

11 短双歧杆菌 直接添加   6079

12 短小芽孢杆菌 直接添加   9003

13 发酵乳杆菌 直接添加   6233   22808

14 粪肠球菌 直接添加   20419

15 副干酪乳杆菌 直接添加   22709   20262

16 干酪乳杆菌 直接添加   6117

17 解淀粉芽孢杆菌 β-葡聚糖酶产淀粉酶   20178

18 枯草芽孢杆菌 木聚糖酶 产淀粉酶 麦芽糖酶 β-葡聚糖酶 蛋白酶 直接添加   10090   20179 /   9011   10071   20872

19 两歧双歧杆菌 直接添加   6071

20 罗伊氏乳杆菌 直接添加   6226

21 凝结芽孢杆菌 直接添加   21736

22 青春双歧杆菌 直接添加   6070

23 乳酸肠球菌 直接添加 /

24 乳酸片球菌 直接添加   10346

25 谷氨酸棒杆菌（目录名：乳糖发酵短杆菌） L-赖氨酸   20189

26 屎肠球菌 直接添加   20430

27 嗜热链球菌 直接添加   6063

28 嗜酸乳杆菌 直接添加   6074

29 酸解支链淀粉芽孢杆菌 淀粉酶 /

30 戊糖片球菌 直接添加   22734

31 发酵乳杆菌（目录名：纤维二糖乳杆菌） 直接添加   6233

32 长双歧杆菌婴儿亚种（目录名：婴儿双歧杆菌） 直接添加   6069

33 沼泽红假单胞菌 直接添加   23812

34 植物乳杆菌 直接添加   6009

35 毕赤酵母 植酸酶木聚糖酶 / /

36 产朊假丝酵母 直接添加   1314

37 红法夫酵母 着色剂   33064

38 酿酒酵母 直接添加   1421

39 长柄木霉（长枝木霉/李氏木霉） 木聚糖酶 甘露聚糖酶 纤维素酶 产淀粉酶   41493   40852   40202 /

40 地顶孢霉 其他 /

41 孤独腐质霉 纤维素酶 木聚糖酶 / /

42 黑曲霉 直接添加 木聚糖酶 蛋白酶 果胶酶 甘露聚糖酶 脂肪酶葡萄糖氧化酶 β-葡聚糖酶纤维素酶淀粉酶 α-半乳糖苷酶   2238   2238   2238   2208   2462   2475   2151 /   40851   2243 /

43 棘孢曲霉 果胶酶   2653

44 米曲霉 直接添加 蛋白酶 淀粉酶   2078   2035   40337

45 绳状青霉 β-葡聚糖酶纤维素酶   40279 /

46 特异青霉 葡萄糖氧化酶 /

注：上表中菌株性能仅供参考